基尔大学创办于1665年，历史悠久，学科门类齐全，是德国富有传统的大学之一。一批享有声望的科学家曾在此任教，如马克斯·普兰克（MaxPlanck），海因里希·赫茨（HeinrichHertz），以及于1950年获诺贝尔奖的化学家奥托·迪尔斯（OttoDiels），他是在基尔任教过的总共6名诺贝尔奖获得者中的最后一名。 第二次世界大战期间，基尔大学除校属医院之外，几乎所有的大学建筑物都毁于空袭。1945年后，基尔大学在基尔市西北郊一块约80公顷的土地上进行了重建和扩建。只有校属医院还留在市中心附近的原大学旧址上。现在除了少数几个部门外，大学的所有院、系、诊所均被安排在崭新的配有现代化设施的大楼里。
学术能力
基尔大学于1994年兼并了原教师进修学院，成立了教育科学学院，是最年轻的学院；技术学院始建于1990年，其开设的专业有电子工程、材料科学和计算机技术；基尔大学的海洋研究已经历了一百多年的历史，今天她仍在广泛的领域开展研究，从事这一领域研究的主要有海洋科学研究所（Institut fuer Meereskunde）、海洋地球科学研究中心（Forschungszentrum fuer marina Geowissenschaften）以及一系列由地球科学系和物理系共同构成的研究海洋测量技术的研究所，这一颇具潜力的研究重点放在二个专业海洋研究所和一个研究生院。
基尔大学的经济学研究享有世界声誉，特别是在金融领域的研究，尽管还没有经济学研究生院，但是经济学的开创性研究吸引了一大批高素质的学生，享有世界声誉的世界经济研究所（Institut fuer Weltwirtschaft an der Universitaet Kiel）拥有面向全国的经济与社会科学中心图书馆，使得基尔大学的经济学研究人员和研究生获益匪浅；远在环境与生态系统研究的重要性被人们认识之前，基尔大学便开展了环境与生态系统的研究，根据合作协议，大学与基尔生态研究中心合作开展了跨学科的研究，环境研究中心还为其它专业的研究生提供获取专业证书的学习机会。
在医学研究领域，基尔大学医院对骨盆腔检查的器械和外科手术的发展，以及对世界范围内的最少感染外科手术的发展具有决定性的影响，基尔大学医学院的学生历年最后的书面理论考试成绩均名列前茅。基尔大学优先重视基础研究，但在自然科学、医学以及经济学和农业科学等许多领域都同时开展理论和技术的研究，并且将技术转让视作一项重要任务。
由於开展了跨学科的研究，特别是在“波罗的海研究”这一专业领域，人文学院取得了令人瞩目的研究成果，北欧研究中心已完成的研究成果对学生特别具有吸引力，通过建立跨学科的研究中心，如北欧研究中心、东欧研究中心和北美研究中心，人文学院在研究和教学领域重视与其它国家和地区的联系，其所提供的大量课程，除吸引本学院的学生外，还吸引了大批来自其它专业和学院的学生。
基尔大学处于德国的最北端，她自创建以来就与邻邦丹麦和所有斯堪的纳维亚地区的国家建立了密切的联系，因为作为斯堪的纳维亚地区北端和波罗的海沿岸国家的一员，它应该发挥特殊的作用。根据姐妹友好关系和另一些友好关系协定，基尔大学与上述这些国家的许多大学之间的联系正在日益加强；
德国-挪威研究中心使得基尔大学与挪威所有的大学和学院都建立了合作关系；并且，基尔大学的国际联系已突破了地域性，它不再局限于欧洲，而是扩展到欧洲之外的美国和中国，与东欧国家的联系也正在突破地域限制，且有着良好前景。世界范围内的广泛联系，国家间的交流，以及众多的研究项目都促进了国际合作。